MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN6

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009652	CTT	2	6	11	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009652	GCT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009652	CGC	2	6	71	76	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009652	TGAG	2	8	102	109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009652	ACA	2	6	175	180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973831
6	NC_009652	CTG	2	6	230	235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973831
7	NC_009652	CTTGAT	2	12	251	262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152973831
8	NC_009652	GAT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973831
9	NC_009652	AAC	2	6	408	413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973832
10	NC_009652	TTAA	2	8	424	431	50 %	50 %	0 %	0 %	152973832
11	NC_009652	CTG	2	6	575	580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973832
12	NC_009652	CTT	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973832
13	NC_009652	TGG	2	6	733	738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973832
14	NC_009652	A	6	6	748	753	100 %	0 %	0 %	0 %	152973832
15	NC_009652	CTC	2	6	839	844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009652	CA	3	6	860	865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009652	AAAATT	2	12	872	883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009652	AGTT	2	8	906	913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009652	T	6	6	931	936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009652	TTTA	2	8	941	948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009652	GAC	2	6	966	971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009652	GTC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009652	TAA	2	6	1039	1044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009652	GTT	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009652	T	6	6	1080	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009652	GTG	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009652	GTC	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009652	GTC	2	6	1305	1310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009652	CCA	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009652	AGT	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009652	T	6	6	1502	1507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009652	ATC	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009652	GGTA	2	8	1557	1564	25 %	25 %	50 %	0 %	152973833
34	NC_009652	AAT	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
35	NC_009652	GCT	2	6	1742	1747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973834
36	NC_009652	TAG	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
37	NC_009652	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	152973834
38	NC_009652	AAAATA	2	12	1778	1789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	152973834
39	NC_009652	TCA	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973834
40	NC_009652	TTC	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973834
41	NC_009652	GTT	2	6	1982	1987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973834
42	NC_009652	ATA	2	6	2027	2032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
43	NC_009652	A	8	8	2048	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	152973834
44	NC_009652	AAT	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
45	NC_009652	ATT	2	6	2148	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973834
46	NC_009652	TTTA	2	8	2161	2168	25 %	75 %	0 %	0 %	152973834
47	NC_009652	TAA	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
48	NC_009652	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
49	NC_009652	GTA	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
50	NC_009652	TTG	2	6	2286	2291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973834
51	NC_009652	TGA	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
52	NC_009652	AATATA	2	12	2390	2401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
53	NC_009652	A	7	7	2423	2429	100 %	0 %	0 %	0 %	152973834
54	NC_009652	GAGC	2	8	2474	2481	25 %	0 %	50 %	25 %	152973834
55	NC_009652	TGG	2	6	2512	2517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973834
56	NC_009652	TC	4	8	2594	2601	0 %	50 %	0 %	50 %	152973834
57	NC_009652	AT	4	8	2634	2641	50 %	50 %	0 %	0 %	152973834
58	NC_009652	TAC	2	6	2648	2653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973834
59	NC_009652	TAA	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
60	NC_009652	TGA	2	6	2680	2685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
61	NC_009652	TAA	2	6	2806	2811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
62	NC_009652	AAT	2	6	2815	2820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973834
63	NC_009652	GATTT	2	10	2876	2885	20 %	60 %	20 %	0 %	152973834
64	NC_009652	T	6	6	2883	2888	0 %	100 %	0 %	0 %	152973834
65	NC_009652	ATG	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973834
66	NC_009652	CTTTT	2	10	2967	2976	0 %	80 %	0 %	20 %	152973834
67	NC_009652	TTA	2	6	2985	2990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973834
68	NC_009652	AGA	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973834
69	NC_009652	TAAA	2	8	3073	3080	75 %	25 %	0 %	0 %	152973835
70	NC_009652	TGTTT	2	10	3083	3092	0 %	80 %	20 %	0 %	152973835
71	NC_009652	GTT	2	6	3132	3137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973835
72	NC_009652	TGA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973835
73	NC_009652	CAAG	2	8	3223	3230	50 %	0 %	25 %	25 %	152973835
74	NC_009652	A	7	7	3380	3386	100 %	0 %	0 %	0 %	152973835
75	NC_009652	ATC	2	6	3398	3403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973835
76	NC_009652	TAAT	2	8	3445	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	152973835
77	NC_009652	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973835
78	NC_009652	TGA	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973835
79	NC_009652	ATT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973835
80	NC_009652	TGC	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973835
81	NC_009652	AG	3	6	3579	3584	50 %	0 %	50 %	0 %	152973835
82	NC_009652	ATGA	2	8	3603	3610	50 %	25 %	25 %	0 %	152973835
83	NC_009652	AGT	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009652	GA	3	6	3712	3717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009652	GAA	2	6	3719	3724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009652	ACC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009652	GGT	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009652	GGA	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009652	GCT	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009652	G	6	6	4000	4005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009652	CCA	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009652	G	6	6	4227	4232	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009652	ACG	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.